從本質(zhì)意義上說，《中華人民共和國仲裁法》所規(guī)定的仲裁制度與《企業(yè)勞動爭議處理條例》規(guī)定的勞動爭議“仲裁”制 度是截然不同的。《仲裁法》所規(guī)定的仲裁制度，是我國按照國際通行慣例在民商事領(lǐng)域內(nèi)統(tǒng)一建立的法律制度;而現(xiàn)行的勞動爭議“仲裁”制度則是國家針對勞動爭議的特殊性，在該領(lǐng)域設(shè)立的處理勞動爭議的專門制度，其與有關(guān)國際公約所稱的仲裁并無任何聯(lián)系。《中華人民共和國仲裁法》第七十七條特別規(guī)定勞動爭議仲 裁另行規(guī)定，不適用仲裁法。歸納起來，兩者主要有以下區(qū)別：

　　(一)在機構(gòu)設(shè)置方面，仲裁委員會不按行政區(qū)劃層層設(shè)立，可以在直轄市和省、自治區(qū)人民政府所在地的市設(shè)立，也可以根據(jù)需要在其他設(shè)區(qū)的市設(shè)立;而勞動爭議仲裁委員會是按行政區(qū)劃分別在縣、市和市轄區(qū)等設(shè)立的處理勞動爭議的特別機構(gòu)，其常設(shè)辦事機構(gòu)設(shè)于各同級勞動行政主管部門內(nèi)。

　　(二)在受案范圍方面，仲裁涵蓋民事、經(jīng)濟的絕大多數(shù)領(lǐng)域，包括各類合同糾紛和其他財產(chǎn)權(quán)益糾紛;而勞動爭議仲裁僅限于勞動爭議。

　　(三)在管轄方式方面，仲裁實行協(xié)議管轄，當(dāng)事人可自主選擇訴訟或者仲裁，也可自主選定仲裁委員會;而勞動爭議仲裁實行地域管轄和級別管轄，當(dāng)事人之間發(fā)生勞動爭議后不得直接向人民法院起訴，而必須先申請勞動爭議仲裁且當(dāng)事人之間無需訂有仲裁協(xié)議。

　　(四)在裁決效力方面，仲裁實行一裁終局制度，裁決一經(jīng)作出，即發(fā)生法律效力;而勞動爭議仲裁裁決是非終局性的，當(dāng)事人不服還可以向人民法院起訴。